במרכזי אתג"ר פועלת תוכנית תלת שנתית היוצאת לפועל בשני שלבים – שנתיים ב"אתג"ר" ושנה ב"מהבית לבית הספר".
-
תוכנית אתג"ר מיועדת למשפחות עם ילדים בגילי 3-4 שנים, והיא נותנת מענה לילדים ולהורים כאחד. מדריכות מלוות כל משפחה ומבצעות מעקב אחר התפתחות הילד.
מטרת הפעילות היא חיזוק הקשר בין הורה וילד, ללמד את ההורה כיצד ללמד את ילדיו ומתן כלים להתמודדות עם קשיים להורים. אחת לשבועיים ההורים מגיעים למרכז ומקבלים הדרכה לפי חוברת עבודה, והפעילות נעשית הן במרכזי אתג"ר והן בבית הילד.
-
תוכנית "מהבית לבית הספר" היא תוכנית משותפת המיועדת לילדים העולים לכיתה א' והוריהם. התוכנית מתמקדת בפיתוח המוכנות הרגשית, הקוגניטיבית והחברתית אצל הילד, בחיזוק ההתפתחות והלמידה בתחומים שונים, תוך עידוד יוזמה ויצירתיות במשחק ובפתרון בעיות, לצד טיפוח יחסים חברתיים בין הילדים.
רכישת המיומנויות והשליטה בהן מבעוד מועד, לפני הכניסה לכיתה א', מסייעת בחיזוק הביטחון העצמי ובפיתוח דימוי עצמי חיובי אצל הילד.